神曲味甘、辛，性温。主要用为帮助消化药。能开胃健脾，化食消积。对于饮食积滞而致胃胀、腹痛、食欲不振等症，可配合麦芽、山查、炒菜菔子、藿香、陈皮、枳实等同用。对于饮食久积、痰食互结而生癖块症瘕等，可配山查核，苍术、白术、三棱、莪术、麦芽、红花，桃仁、生牡蛎，炙鳖甲等同用。对脾胃虚弱、食欲不振，消化不良等症，可配党参、白术，茯苓、炙甘草、陈皮、谷芽，麦芽等同用。本品炒焦用，消食的效力可增强，故消寻药中常用焦神曲．生用除健脾开胃外，兼有些发散之力，故停食兼有外感发热者，宜生用。本品有帮助金石药晶消化、吸收的作用，故使用磁石、代赭石等金石药品时，可佐用一些神曲。既能助运化，又能保护消化功能。
用量一般一至三钱。