白豆蔻味辛，性温。是常用的行气，化湿，健胃，止呕药。能宣散肺中滞气，温行胃中寒气，燥化脾经湿气。适用于脾胃虚寒、湿郁或气滞而导致的消化不良，呕吐反胃，胸脘满闷，腹部胀痛等症。常配合藿香、半夏、陈皮、生姜、丁香等同用。
本品有芳香行气温燥化湿的特长，可用于治疗夏秋之交发生的湿温病（身热不扬，有汗而热不退、头痛身重胸脘堵闷，食欲不振，口不渴或口甜，小便不利、舌苔白厚滑腻、脉象濡滑缓）。常配合杏仁、苡仁，厚朴，半夏、滑石，通草、竹叶（三仁汤）等同用，而收到辛开，苦降、淡洛的功效，是治疗湿温最常用的方药。
白豆蔻配陈皮、生麦芽、香稻芽等，可用于食欲不振，配高良姜、香附、干姜，吴萸等，可用于胃寒疼痛。白蔻衣（即白蔻皮）长于理气宽胸消胀，温性较白蔻小，可应证选用。
用量一般五分至二钱。着去皮使用，名白蔻仁。入汤药‘后下”药效较好。
肺胃火盛及气虚者忌用。
注意：处方上如果只写“蔻仁’药房即给紫蔻仁。紫蔻仁主用为芳香行气，温中调胃药。功效介于砂仁与自蔻之间，芳香温燥之性，比砂仁较小，但比白蔻稍强。故在调胃药中，有时可以紫蔻仁代替砂仁。