祖国医学，源远流长，经典医籍，浩如烟海。年复于年，世代流传，脱漏衍文，在所难免，错简讹误，屡见不鲜。点校原著，旧疑冰释，播之后代，其乐无穷。
麻瑞亭进入80高龄之年，毅然承担国家卫生部下达的中医古籍整理研究任务，领衔点校《黄元御医书十一种》。1985年10月，完成《素问悬解》、《灵枢悬解》、《难经悬解》三部，计63.3万字；1986年3月，完成《伤寒悬解》、《金匮悬解》、《伤寒说意》三部，计58.8万字；1987年7月又完成《四圣心源》、《四圣悬枢》、《素灵微蕴》、《长沙药解》、《玉楸药解》五部，计48.6万字；整理170.7万字，分上、中、下三册，勒成《黄元御医书十一种》，人民卫生出版社于1990年出版发行，1991年获“国家中医药管理局中医药科技进步三等奖”、“陕西省中医药科技成果二等奖”，1992年获“中华人民共和国全国首届古籍整理图书丛书奖”。实现了他数十年的一桩夙愿。